Ha permitido lograr la transferencia tecnológica y el fortalecimiento del recurso humano necesario para la óptima prestación de bienes y servicios, a través del intercambio técnico-científico entre países, en el marco de la cooperación horizontal. Desde 1993 se iniciaron vínculos entre países latinoamericanos, buscando alianzas estratégicas en instituciones homólogas, tendientes a fortalecer y compartir avances y experiencias que permitieran el fortalecimiento institucional de los países signatarios apoyando a países hermanos que así lo demandaron.

Esta actividad tiene como objetivo el fortalecimiento de las competencias institucionales a través de visitas técnicas, pasantías de entrenamiento, intercambio de experiencias o realización de trabajos de investigación conjuntos en cada uno de los Institutos involucrados.

El financiamiento para la ejecución de la Cooperación Técnica Bilateral se lleva a cabo a través del sistema de costos compartidos entre los países demandantes y oferentes de la Cooperación; por otra parte se cuenta con el apoyo de agencias de cooperación en los países, especialmente la Oficina Panamericana de la Salud (OPS), a través de la suscripción de Tratados de Cooperación Técnica entre Países (TCC).